Ohutuse küsimus on kiibi häälestamise puhul alati esmane. Kõik muudatused, mida tehakse auto elektroonilises juhtplokis, võivad mõjutada kogu sõiduki toimimist. Seetõttu on oluline, et kiibi häälestamist teostaks kogenud spetsialist, kes teab täpselt, mida ja kuidas muuta. Halvasti teostatud kiibi häälestamine võib viia tõsiste probleemideni, sealhulgas mootori ülekuumenemise, ebastabiilse töö ja isegi püsiva kahjustuseni.
Üks potentsiaalne oht on mootori ülekoormamine. Kui häälestamine suurendab mootori võimsust, tähendab see, et mootori komponente koormatakse rohkem kui tootja poolt ette nähtud. See võib lühendada mootori eluiga ja põhjustada suuremat kulumist. Näiteks võib turbolaadur töötada kõrgemal rõhul, mis omakorda koormab mootorit rohkem ning võib tekitada probleeme, kui auto sisemised komponendid pole sellise koormusega harjunud.
Teine aspekt, mida tuleb arvesse võtta, on garantii. Kui su auto on veel garantii all, võib kiibi häälestamine garantii kehtetuks muuta. Tootjad näevad tihti, et kiibi häälestamine rikub auto algset konfiguratsiooni, mistõttu nad ei pruugi enam katta võimalikke remonditöid, mis on seotud mootori või elektroonikaga. Enne kiibi häälestamist on alati mõistlik konsulteerida auto esindusega ja selgitada välja, millised tagajärjed sellega kaasnevad.
Lisaks võib kiibi häälestamine mõjutada auto heitgaaside norme. Euroopa Liidus ja paljudes teistes piirkondades on ranged heitgaaside regulatsioonid, mis määravad, kui palju kahjulikke aineid auto võib õhku paisata. Kui kiibi häälestamine muudab mootorit selliselt, et heitgaaside hulk suureneb, võib auto rikkuda regulatsioone, mis omakorda tähendab, et seda ei pruugita lubada tehnilisele ülevaatusele. See on üks oluline aspekt, mida tuleb häälestamise käigus kindlasti silmas pidada.